Według słownika Merriam-Webster "niepatogenny" oznacza, że organizm nie powoduje choroby, więc niepatogenne bakterie nie powodują choroby. Niektóre bakterie są pomocne w ich środowisku.
Na przykład ludzki przewód pokarmowy zawiera bakterie, które pomagają mu prawidłowo funkcjonować. Te bakterie nie tylko pomagają w procesie trawienia, ale także zabijają bakterie chorobotwórcze. Bakterie są wykorzystywane do produkcji niektórych produktów mlecznych, takich jak ser, śmietana i jogurt. W świecie przyrody niektóre bakterie działają jako rozkładacze, rozkładając martwe organizmy. Inne rodzaje bakterii zużywają olej, a ta naturalna tendencja jest najbardziej widoczna podczas wycieków lub wycieków ropy.
