Francesco Pizarro poślubił Ines Huaylas Yupanqui i miał jedno dziecko o imieniu Francesca Pizarro Yupanqui. Jego data urodzenia jest niepewna, ale uważa się, że była między 1471 a 1476 rokiem. Francesco Pizarro zmarł w 1548 roku .
Francesco Pizarro był dzieckiem nieślubnym. Jego ojciec był hiszpańskim żołnierzem, a matka - służącym. Wyrósł na jednego z największych konkwistadorów hiszpańskich i był markizem de la Conquista. 9 kwietnia 1548 r. Został pokonany podczas walki z siłami hiszpańskimi pod wodzą namiestnika Pedro de la Gasca. Został schwytany i zabity.