W białkach występują wiązania peptydowe. Białka składają się z aminokwasów, a wiązania peptydowe utrzymują je w łańcuchach polipeptydowych.
Gdy dwa aminokwasy wiążą się ze sobą poprzez wiązanie peptydowe, wynik nazywany jest dipeptydem. Kiedy powstaje wiązanie peptydowe pomiędzy dwiema cząsteczkami aminokwasów, zachodzi reakcja kondensacji; dotyczy to cząsteczki wody uwalnianej podczas procesu wiązania. Może również wystąpić odwrotność; jest to reakcja hydrolizy i odnosi się do cząsteczki wody dodawanej do wiązania aminokwasowego i dzielącej oryginalną cząsteczkę na dwie części.