Śluz żołądka chroni komórki przewodu pokarmowego przed uszkodzeniem, które mogą powodować soki żołądkowe. Soki żołądkowe są bardzo kwaśne i bez tego śluzu kwas może zniszczyć komórki i tkanki w żołądku.
Śluz w żołądku jest bogaty w wodorowęglany, związek alkaliczny, który pomaga smarować i chronić żołądek. Kwas żołądkowy pochodzi z komórek okładzinowych, typu komórki żołądkowej, i jest to kwas chlorowodorowy, który jest roztworem wody i chlorowodoru. Dzięki temu środowisko w żołądku jest bardzo kwaśne. Wysoki poziom kwasowości ma kluczowe znaczenie dla dezaktywacji bakterii w żywności spożywanej przez ludzi i aktywacji pepsynogenu, rodzaju enzymu.