Najbardziej gorszą częścią pnia mózgu jest rdzeń przedłużony. Znajdujący się tuż poniżej móżdżka mózgu i przedni do móżdżku, rdzeń oblongata jest odpowiedzialny za wiele życiowych mimowolnych funkcji ciała, takich jak oddychanie, trawienie i serce oraz funkcja krążenia.
Ta część pnia mózgu służy również do przekazywania wiadomości z rdzenia kręgowego do mózgu i pomaga w koordynacji organizmu. Ponieważ większość nerwów związanych z kontrolowaniem mięśni krtani, gardła i aksamitu znajdują się w rdzeniu, konieczne jest również funkcjonowanie mowy i połykania.