Lewis i Clark przekroczyli pasmo górskie Bitterroot, północny odcinek Gór Skalistych. Mimo, że szczyty Bitterroots wynoszą od 9000 do ponad 11 000 stóp, znaleźli drogę na zachód przez góry Lolo Pass, która znajduje się na wysokości 5,236 stóp.
Jednym z głównych celów ekspedycji Lewisa i Clarka było poszukiwanie przejścia północno-zachodniego, hipotetycznego szlaku wodnego od Oceanu Atlantyckiego do Pacyfiku. Inne cele obejmowały nawiązanie dyplomatycznego kontaktu z rdzennymi Amerykanami, rozszerzenie handlu futrami na nowe terytoria oraz zbadanie rzeki Missouri, Pacific Northwest i nowo zakupionego Luizjany. Wyruszyli rzeką Missouri w maju 1804 r. Z 33 innymi mężczyznami. W Północnej Dakocie zbudowali Fort Mandan, w którym czekają na zimę. W kwietniu 1805 r. Kontynuowali podróż wzdłuż Missouri, aż dotarli do Gór Skalistych, gdzie musieli kontynuować konno. Po drugiej stronie Kontynentalnego Podziału kontynuowali spływ kajakiem wzdłuż Clearwater i Snake Rivers, aż dotarli do rzeki Columbia, która zabrała ich na Pacyfik.
Lewis i Clark wraz z ludźmi z ich wyprawy, zwanymi Korpusem Odkrycia, przybyli do St. Louis we wrześniu 1806 r. po przebyciu prawie 8000 mil. Zostali przyjęci jako bohaterowie przez Prezydenta Thomasa Jeffersona, Kongres i Amerykanów.
