Protists poruszają się za pomocą rzęsek, wici i pseudopodii. Metoda lokomocyjna zależy od rodzaju gatunku protisty i miejsca jego zamieszkania.
Niektóre ruchy protistów umożliwiają rzęski, które są małymi włoskowatymi projekcjami, które rozciągają się od ich powierzchni lub z wnętrza komórek. Cilia umożliwia protistom poruszanie się w rytmicznych wzorach podczas pływania w wodzie. Inne protisty poruszają się za pomocą wici, które są długimi i nitkowatymi przydatkami, które wyglądają jak długie bicze i pomagają organizmom poruszać się stabilnie przez prądy i fale. Pseudopodia jest trzecim typem lokomocji protisty. Ten ruch obejmuje tymczasowe rzucanie cytoplazmy przez określone komórki, takie jak fagocyty.
