Głównymi wadami wielorybnictwa są potencjalne wyginięcie niektórych gatunków wielorybów, niebezpieczne poziomy rtęci, które może zawierać mięso wielorybów, oraz potencjalna szkodliwość dla ekosystemów, które mogą powodować usunięcie wielorybów. Ponadto wieloryb Obserwacja jest lukratywnym biznesem w wielu częściach świata, a wielorybnictwo może mieć wpływ na tę działalność, według Nature Publishing Group.
Poważny problem z ośrodkami wielorybnictwa w zakresie wpływu na populacje wielorybów. Na przykład szare wieloryby wyginęły na Atlantyku od setek lat. Uważa się również, że może być zaledwie 4 procent całkowitej populacji błękitnych wielorybów, które żyły przed rozpoczęciem eksploatacji.
Mniej wielorybów może mieć również wpływ na ekosystem. Kiedy wieloryb umiera, jego ciało opada na dno oceanu. Na dnie oceanu ciało wieloryba dostarcza pokarm wielu różnym istotom, które zwykle nie mają dostępu do tak obfitego pożywienia.
Podczas gdy wielu zwolenników wielorybnictwa twierdzi, że praktyka tworzy miejsca pracy i wkłada pieniądze do gospodarki, ma także potencjał do niszczenia gospodarki kraju. Szacuje się, że turystyka morska związana z obserwacją wielorybów może generować 413 milionów dolarów rocznie. Ponadto, mięso wielorybów, które jest źródłem dochodów z wielorybnictwa, może zawierać niebezpieczne poziomy rtęci i prowadzić do zatrucia rtęcią.
