Grzyby pełnią istotną rolę w ekosystemach. Są odpowiedzialni za rozkład materii organicznej; usuwanie i recykling materii organicznej na ziemi, dostarczając w ten sposób składników odżywczych i żywności dla roślin, zgodnie z Rainforest Conservation Fund. Ponadto grzyby są odpowiedzialne za wiązanie azotu w glebie.
W biosferze grzyby odgrywają zasadniczą rolę jako podstawowe rozkładające i wtórne substancje odżywcze. Grzyby są obecne i odgrywają tę rolę we wszystkich siedliskach Ziemi. Bez grzybów rośliny straciłyby swoje główne źródło składników odżywczych, materię organiczną poddaną recyklingowi przez grzyby. Grzyby pełnią także role mutualistyczne w stosunku do wielu innych rodzajów organizmów.
Utrwalanie azotu jest kolejnym ważnym wkładem grzybów w ekosystemy, czytamy w czasopiśmie Science. Wykazano, że wiązanie azotu przez grzyby przyczynia się do biomasy mrówek liściowych w ramach związku symbiotycznego.
Grzyby tworzą wzajemne relacje z cyjanobakteriami i zielonymi algami, tworząc tym samym porosty. Podobne wzajemne relacje powstają z różnych rodzajów owadów. Pozytywny wkład tych bakterii i owadów pokazuje korzystne role, jakie grzyby odgrywają w biosferze.
Podczas gdy niektóre grzyby powodują choroby u ludzi, inne znacząco i pozytywnie wpływają na naszą zdolność do przetrwania poprzez recykling składników odżywczych i produkcję pokarmu roślinnego z detrytusu i gleby.
