Kilka rodzajów zwierząt jedzących nietoperze w ramach ich diety, w tym sowy, jastrzębie, węże i pająki. Mimo że nietoperze mają wiele drapieżników, tylko para używa nietoperzy jako jedynego źródła pożywienia .
Rodzaje zwierząt, które jedzą nietoperze różnią się w zależności od lokalizacji i wielkości nietoperza. Oprócz dzikich zwierząt nietoperze stają w obliczu poważnego zagrożenia w postaci wspólnego kota domowego, który jest jedynym zwierzęciem zdolnym do siedzenia na dachu i chwytania latającego nietoperza z powietrza.
Chociaż wiele zwierząt poluje na nietoperze, ludzie są największymi zabójcami nietoperzy. Wiele osób uważa je za szkodniki i nie chce ich w swoich domach i podwórkach.