Protony i neutrony odpowiadają za większość masy atomu. Te subatomowe cząsteczki znajdują się w jądrze atomu, gdzie tworzą nukleony.
Protony i neutrony mają bardzo podobne masy atomowe. Neutrony mają masę atomową 1,0078 amu, podczas gdy protony mają masę atomową 1,0073 amu, według UC Davisa ChemWiki. Elektrony są najlżejszymi cząstkami subatomowymi. W przeciwieństwie do protonów i neutronów elektrony krążą wokół jądra w orbitalach. Elektrony mają masę atomową 0,00054858 amu. Neutrony nie wpływają na całkowity ładunek atomu, ale odgrywają rolę w tworzeniu się izotopów, które są atomami tego samego elementu, które mają różną liczbę neutronów.