W czasach niskiego zapotrzebowania na żywność nietoperze mogą przejść w stan hibernacji lub migracji. Gdzie nietoperze żyją, zależy od dostępności żywności w danym obszarze.
Nietoperze mogą migrować lub hibernować z powodu ostrych zmian klimatu. Migracja polega na opuszczeniu jednego miejsca, gdy zapasy żywności zmniejszają się i powracają do tego samego miejsca, gdy zaopatrzenie w żywność staje się znowu obfite. Niektóre nietoperze wybierają sen lub hibernują w okresach ograniczonej dostępności pokarmu. Kilka gatunków nietoperzy może w rzeczywistości migrować i hibernować, jeśli tak zdecydują, takie jak srebrnowłosy nietoperz i czerwony nietoperz. Drzewa z nietoperzami zwykle migrują, ponieważ drzewa zapewniają schronienie przed zimowymi warunkami.