Atom kobaltu zawsze ma dokładnie 27 protonów. Liczbę protonów w atomie można znaleźć w górnym lewym rogu jego wpisu w układzie okresowym, wymienionym jako liczba atomowa elementu. . Liczba atomowa kobaltu wynosi 27.
Kobalt przenosi również 27 elektronów. Ładunek ujemny elektronów precyzyjnie równoważy ładunek dodatni protonów, tworząc ładunek zerowy netto dla całego atomu. Wiadomo, że kobalt ma tylko jeden stabilny izotop, kobalt 59. Ustalenie liczby neutronów w tym izotopie jest tak proste, jak odjęcie 27 protonów od ich ciężaru atomowego 59, by dotrzeć do 32 neutronów.
