Temperatura wpływa na procent kiełkujących nasion i szybkość kiełkowania. Nasiona utrzymywane w wyższych temperaturach z większym prawdopodobieństwem ulegają pogarszaniu i nie kiełkują. Gdy nasiona zaczną kiełkować, wyższe temperatury przyspieszają kiełkowanie do optymalnej temperatury, po czym prędkość kiełkowania maleje.
Optymalna temperatura dla szybkości kiełkowania różni się w zależności od gatunku. Suche nasiona są bardziej podatne na kiełkowanie w wyższych temperaturach, ale mokre nasiona są mniej podatne na kiełkowanie w wyższych temperaturach. Na przemian temperatury na zimno i na gorąco prawdopodobnie pobudzi wiele mokrych nasion do kiełkowania. Niektóre gatunki nasion są stymulowane do kiełkowania w bardzo niskich temperaturach.
