Przykład specjacji sympatrycznej można zaobserwować w zmianie nawyków wylęgu jaj robaka jabłoniowego, zaobserwowanej po raz pierwszy na początku XIX wieku. Specjacja sympatryczna muchy jabłoniowej pojawiła się jako wynik zmian w roślinach, na których samice złożyły swoje jaja.
Specjacja sympatryczna opisuje specjację, która występuje przy braku izolacji geograficznej, gdy niektórzy członkowie gatunku rozmnażają mutację pomimo obfitości niezmutowanego genu w puli genów. Na przykład, gdy robaki jabłkowe zaczęły składać jaja na liściach jabłoni domowej, a nie liściach Hawthorne, gatunek zaczął podlegać specjacji sympatrycznej. Specjacja sympatryczna jest stosunkowo rzadką formą specjacji.
