Białka przenoszące się z retikulum endoplazmatycznego do aparatu Golgiego przemieszczają się wewnątrz transportowanych przez COPII nośników transportu. Według czwartego wydania Biologii Molekularnej Komórki na stronie internetowej NCBI, pęcherzyki transportowe są ściągnięte z obszaru retikulum endoplazmatycznego, znanego jako miejsca wyjścia z ER. Te miejsca wyjścia nie mają rybosomów związanych z błoną, które w przeciwnym razie opóźniłyby proces.
Wybrane białka ładunku grawitują w kierunku pęcherzyków transportowych, gdzie ostatecznie zostają skoncentrowane. Naukowcy są przekonani, że te białka ładunku mają sygnał wyjściowy, który ostrzega komplementarne białka receptora przed obecnością powłoki COPII w pączkującym pęcherzyku. Pomaga to w dopełnianiu się białek do pęcherzyka. Jednak niektóre białka bez sygnałów wyjściowych, które zwykle pozostają w ER, są również pakowane w pączkujące pęcherzyki, aby przejść do aparatu Golgiego. Około 200 białek błonowych, często różnego rodzaju, znajduje się w przeciętnym 50-nanometrowym pęcherzyku transportowym.
Jednak nie wszystkie białka wymagają pęcherzyka. Gdy wydzielnicze białka są wytwarzane w bardzo wysokich stężeniach, niektóre z nich wyciekają z ER bez pomocy sortowania receptorów. Z drugiej strony, inne białka nie mogą w ogóle wyjść. Na przykład, gdy białka są rozwinięte lub źle sfałdowane, są one zatrzymywane w ER w białku opiekuńczym.
