Benzofenon nie rozpuszcza się w wodzie, ponieważ jest niepolarny, a woda polarna. Biegunowość dowolnych dwóch chemikaliów jest jednym z najważniejszych czynników przy określaniu rozpuszczalności lub nierozpuszczalności. Pod tym względem benzofenon i woda są niezgodne, a zatem nierozpuszczalne.
Rozpuszczalność to zdolność substancji chemicznej do rozpuszczania podczas reakcji w innej substancji. Rozpuszczalność jest bardzo ściśle związana z polarnością. W chemii substancja polarna ma nierównowagę gęstości elektronowej. Innymi słowy, ma wiele różnych właściwości fizycznych w różnych punktach wzdłuż jego struktury. Cząsteczki wody są polarne, ponieważ powstają w sposób, który daje jeden częściowo ujemny koniec i jeden częściowo pozytywny koniec. Aby substancja chemiczna była rozpuszczalna w wodzie, musi być zdolna do wiązania się z cząsteczkami wody. Jednak cząsteczki benzofenonu są zbudowane w taki sposób, że mają te same fizyczne reakcje na inne chemikalia we wszystkich punktach ich struktur cząsteczkowych. Ponieważ woda jest polarna, a benzofenon jest niepolarny, nie powodują one wzajemnych reakcji wstępnych dla rozpuszczalności. Cząsteczki benzofenonu nie mogą wiązać się z cząsteczkami wody i nie rozpuszczają się. Jednak benzofenon jest rozpuszczalny w innych polarnych substancjach, z którymi może się wiązać.
