Archaea, bakterie, Protista, grzyby, wirusy i połączenia drobnoustrojów są podziałami, które zawierają mikroorganizmy. Większość drobnoustrojów to organizmy jednokomórkowe. Drożdże piekarnicze i drożdże rozszczepialne to jednokomórkowe mikroorganizmy.
Archaea to organizmy jednokomórkowe bez jądra. Archaea występują we wszystkich typach siedlisk.
Bakterie to złożone, jednokomórkowe organizmy, które mogą przetrwać w ekstremalnych warunkach. Bakterie są odpowiedzialne za wytwarzanie witamin, rozkładanie materiału i utrzymywanie atmosfery. Bakterie pojawiły się na Ziemi miliardy lat temu.
Microbe World wyjaśnia, że wiele gatunków grzybów zalicza się do mikroorganizmów. Grzyby, które są mikroorganizmami, mają jedną komórkową ścianę z wieloma jądrami rozproszonymi w organizmie.
Protista to mikroorganizmy eukariotyczne, których DNA jest zamknięte w jądrze. Jednokomórkowe glony, pierwotniaki, śluzowce i wodne pleśnie to cztery podgrupy Protistów.
Wirusy to mikroorganizmy, które nie pasują do grup żyjących lub nieożywionych. W stanie obojętnym wirusy działają jak nieżyjące stworzenia, ale gdy są wystawione na odpowiedniego żywiciela, wykazują realistyczne cechy. Wirusy to proste mikroorganizmy, które są 10 000 razy mniejsze od bakterii. Wirusy zawierają niewielkie ilości materiału genetycznego.
Fuzja drobnoustrojów to mikroorganizmy obejmujące Rhizobia, Mycorrhizae i Zooxanthelle. Każdy z tych mikroorganizmów łączy się z innym organizmem.
