Enzymy przyspieszają reakcje chemiczne poprzez obniżanie szybkości aktywacji. Ogólnie rzecz biorąc, im mniejsza ilość energii aktywacyjnej, jaką ma potencjalna reakcja, tym szybsza reakcja. Enzymy zmieniają kształt podczas procesu reakcji, co pozwala im efektywnie zmniejszać wskaźniki aktywacji.
Kiedy enzymy zmieniają kształt, proces ten określa się jako dopasowanie indukowane. Podczas tego procesu enzymy podlegają zasadniczo fizycznym przekształceniom, aby wiązać się z innymi enzymami w reakcjach chemicznych. Enzymy te łączą się z podobnymi enzymami, tworząc pełne reakcje, podobnie jak proces układania puzzli. Enzymy zawierają również gorące punkty lub aktywne miejsca, które są lokalizacjami na powierzchniach enzymów, które umożliwiają wiązanie substratów. Witryny te służą również jako miejsce lokalizacji reakcji chemicznych: miejsca te stanowią centrum działalności i działają podobnie jak stacje kolejowe lub terminale autobusowe, umożliwiając wymianę informacji. Te reakcje chemiczne zachodzą na powierzchniach enzymów, gdzie wiążą się substraty. Miejsca aktywne enzymu są stabilizowane przez wiele słabszych reakcji (takich jak kontakty hydrofobowe, wiązania wodorowe i oddziaływania elektrostatyczne), które ostatecznie umożliwiają im szybkie reakcje chemiczne. Reakcje chemiczne również wymagają wewnętrznej zmiany: jest to możliwe dzięki tworzeniu substratów w obrębie enzymów, które wypływają na powierzchnię i wiążą się z miejscami aktywnymi.
