Dieta Dr. Pepper zawiera kofeinę, która jest niezdrowa w dużych ilościach. Spożywanie czterech lub więcej napojów zawierających kofeinę dziennie może powodować działania niepożądane, takie jak rozstrój żołądka, drżenie mięśni i nieregularne bicie serca. Osoby z wrażliwością na kofeinę mogą cierpieć na bóle głowy i bezsenność nawet z niewielkich ilości kofeiny.
Dieta Dr. Pepper zawiera także aspartam, sztuczny słodzik powszechnie stosowany w napojach bezalkoholowych, gotowych jedzeniach i lekach. Przeprowadzono badania łączące aspartam z niektórymi nowotworami, ale amerykańska Agencja ds. Żywności i Leków nie uznała tych badań za rozstrzygające. Aspartamu należy jednak unikać u pacjentów z fenyloketonurią, ponieważ zawiera ona fenyloalaninę.