Dodany do wrzącej wody, gnocchi gotuje się w około 2 minuty. Gdy gnocchi unoszą się nad wrzącą wodą, jest gotowa do osuszenia i podania.
Specjaliści od gotowania zalecają stosowanie od 4 do 6 litrów wody na gotowany gips. Jeśli gnocchi są zamrożone, najlepiej nie rozmrażać, ale raczej umieścić je bezpośrednio w wrzącej wodzie z zamrażarki i mieszać gnocchi, aż się oddzieli. Mrożony makaron wymaga dodatkowego czasu gotowania. Gotowane gnocchi można przechowywać w lodówce do trzech dni lub zamrażać do miesiąca.