Jedzenie jogurtu niesie ze sobą korzyści zdrowotne, ale podobnie jak w przypadku wielu innych produktów, jedzenie za dużo powoduje niekorzystne skutki. Spożywanie zbyt dużej porcji jogurtu redukuje ilość składników odżywczych potrzebnych organizmowi na co dzień.
Jogurt jest pokarmem bogatym w wapń, a spożywanie zbyt dużej ilości wapnia może powodować problemy, w tym raka prostaty i kamieni nerkowych. Spożywanie dużych ilości wapnia może również powodować nagromadzenie w naczyniach krwionośnych.
Pojemnik jogurtu zawiera duże ilości bakterii, które w przypadku spożycia w dużych ilościach mogą powodować problemy trawienne. Kwestie obejmują biegunki, wzdęcia, gaz i kwaśny żołądek.
Jogurt to zdrowa żywność, gdy jest spożywana z umiarem.