Czas pieczenia może być drastycznie krótszy w przypadku przepisów na mini muffiny, w sumie tylko 10 do 15 minut, a piekarze będą chcieli zachować ostrożność, aby uniknąć nadmiernego pieczenia. Dokładny czas pieczenia mini babeczek będzie zależał od przepisu i temperaturę pieca, ale ogólnie te mniejsze babeczki powinny być pieczone przez krótszy okres czasu niż pełnowymiarowe babeczki, aby uniknąć palenia, suszenia lub innych niepożądanych efektów wynikających z nadmiernego czasu w piekarniku. Należy dokładnie przestrzegać przepisów, aby uniknąć rujnowania partii mini muffin, a jeśli piekarz zdecyduje się zrobić mini muffiny z pełnowymiarowego przepisu na muffiny, piekarz powinien uważnie przyglądać się pieczonym muffinom.
Jeśli dokładny czas pieczenia mini babeczek nie jest dostępny, a piekarz pracuje z pełnowymiarową recepturą babeczki, może on przyjrzeć się bardziej szczegółowemu podejściu, ustalając, o ile mniejsze są mini babeczki, niż pełne - zmieszane babeczki wymagają przepisu i odpowiednio skracają czas pieczenia. Ci, którzy nie są tak dobrzy w matematyce, mogą po prostu umieścić mini babeczki w piekarniku w temperaturze nieco niższej niż jest to wymagane niż pełnowymiarowe babeczki i sprawdzić je po pięciu minutach. Gdy muffiny wydają się podnosić i brązowieć, można je wyjąć i przetestować za pomocą wykałaczki w celu uzyskania dobrego wyglądu.
