Nie pocięty, świeżo upieczony placek z pekanami można przechowywać w temperaturze pokojowej przez dwie godziny, zanim zostanie podany. Jeśli placek z pekanami jest przechowywany w lodówce, utrzymuje on maksymalnie cztery dni.
Placek z pekanami musi być schłodzony po jego pokrojeniu lub jeśli jest przeznaczony do podania przez ponad dwie godziny po przygotowaniu. Zawartość wilgoci w cieście, jak również zawartość białka w jego składnikach, może prowadzić do szybkiego namnażania bakterii, jeśli ciasto może siedzieć w temperaturze pokojowej.
Ciasto pekanowe można przechowywać w zamrażarce przez okres do dwóch miesięcy. Ciasto powinno być przechowywane w wytrzymałej torebce zamrażarki lub opakowane w folię plastikową lub folię aluminiową przed zamrożeniem.
