Chleb Babka mógł pochodzić z Żydów wschodnioeuropejskich, lub może być dalekim krewnym włoskiego pannetone. Dokładne pochodzenie chleba babka jest nieznane.
Chleb Babka mógł pochodzić z Polski lub Ukrainy. Jedna z teorii głosi, że stanowiła część starożytnego rytuału płodności jako część systemu matriarchalnego. Ten rodzaj walcowanego, nadziewanego chleba jest szczególnie popularny w Rosji, Białorusi, krajach bałtyckich, Polsce i na Ukrainie. Nazwa "babka" odnosi się do "babci", słowiańskiego słowa oznaczającego babcię. Jedna z teorii głosi, że tradycyjny polski garnek do pieczenia babki przypomina plisy na spódnicie starej kobiety. Inna teoria mówi, że babcie były głównymi piekarzami tego dania.
Inna teoria mówi, że babka faktycznie pochodzi z Włoch, gdzie jest postrzegana jako "rusyfikowana" wersja włoskiego chleba pannetone. Być może królowa Bona Sforza sprowadziła z nią tradycję do Polski w XVI wieku. Pomysł, że babka powstała we Włoszech jest wspierana przez włączenie czekolady w niektórych wersjach. Żydzi stali się cukiernikami we Włoszech i przywieźli ze sobą tradycję, kiedy uciekli z hiszpańskiej inkwizycji w XV wieku.
Babka była kiedyś znacznie większa niż obecna wersja. Na początku XIX wieku polscy piekarze zaczęli używać ciasta z chałką jajeczną do upieczenia deseru z dżemem, cynamonem lub rodzynkami, które stały się podstawą nowoczesnego chleba babka.