Chipotle pozwala klientom składać zamówienia online do odbioru. Użytkownicy logują się lub tworzą konto i klikną przycisk Zamów teraz. Chipotle zawiera również formularz zamówienia faksu i opcję grupowego zamawiania online, a dla użytkowników telefonów komórkowych aplikacja Chipotle oferuje opcje zamawiania.
Strona zamówienia zawiera opcje entrée, które użytkownicy dostosowują, wybierając mięso, rodzaj ryżu, fasoli i dodatków. Dodatki i napoje pojawiają się również na stronie. Użytkownicy decydują się płacić w sklepie lub w Internecie za pomocą karty kredytowej lub karty podarunkowej. W sklepie klienci, którzy złożyli zamówienia online, idą prosto do rejestru odbioru.
