Zupa z małży może być przechowywana w zamrażarce. Zamrażająca zupa z małży utrzymuje świeżość o wiele dłużej niż chłodzenie, a po prawidłowym zamrożeniu utrzymuje się od czterech do sześciu miesięcy.
Zupę z małży należy umieścić w hermetycznym pojemniku lub torebce do zamrażarki przed przechowywaniem w zamrażarce. Przed zamrożeniem musi wystygnąć do temperatury pokojowej. Nie należy go jednak pomijać dłużej niż dwie godziny. Najlepszym sposobem na rozmrożenie mrożonej chowder jest umieszczenie worka lub pojemnika zupę w dużej misce z gorącą wodą przez kilka minut. Gdy zupa zacznie rozmrażać, umieść ją w garnku i podgrzej na kuchence.
