Sernik musi być przechowywany w lodówce, ponieważ zawiera szybko psujące się składniki, takie jak jajka i śmietanę. Sernik często zawiera inne produkty mleczne, takie jak kwaśna śmietana lub mleko, które również psują się, gdy nie są odpowiednio przechowywane. Zawsze umieszczaj sernik z powrotem w lodówce po jej dostarczeniu.
Zazwyczaj świeżo przygotowywany lub pakowany sernik trwa w lodówce od sześciu do siedmiu dni. Jednak sernik może trwać nawet siedem miesięcy w zamrażarce. Sernik musi być odpowiednio przykryty po umieszczeniu w lodówce, ponieważ wilgoć i inne zanieczyszczenia mogą znacznie skrócić trwałość ciasta.