Surowe tuńczyki można bezpiecznie przechowywać do dwóch dni w temperaturze 39 stopni Celsjusza lub niższej. Schłodzony gotowany tuńczyk można bezpiecznie spożywać przez pięć dni po przygotowaniu. Puszkowany tuńczyk używany w zapiekankach i sałatach będzie trwał przez pięć dni w lodówce.
Tuńczyk, który pozostawiono w temperaturze pokojowej na dłużej niż godzinę, należy wyrzucić, aby uniknąć ryzyka chorób przenoszonych przez żywność. Jeśli tuńczyk ma nieprzyjemny zapach lub jest odbarwiony, nie należy go jeść ani kupować. Żywy kolor skóry, jasne oczy i skrzela, które są jaskrawoczerwone, są wskaźnikami zdrowego i świeżego tuńczyka. Pakowane lub konserwowane tuńczyki nie powinny być spożywane ani kupowane po wymienionej dacie ważności.