Arbuz jest pełen pożytecznych składników odżywczych, ale w dużych ilościach powoduje również pewne nieprzyjemne skutki uboczne. Ponieważ arbuz jest bogaty w błonnik, może wywoływać nawroty w zaburzeniach jelitowych, takich jak choroba Leśniowskiego-Crohna lub zespół jelita drażliwego i powodować gaz, wzdęcia i biegunkę.
Arbuz zawiera również ponad 6 888 mikrogramów (6,8 miligramów) likopenu, silnego przeciwutleniacza, znanego z redukcji stresu, obniżenia poziomu cholesterolu i pomocy w zapobieganiu nowotworom. Jednak według WebMD, badania pokazują, że likopen może pogorszyć istniejącego raka prostaty. Inne badania, odnotowane przez Fitday, również wskazywały, że spożywanie dużych ilości likopenu, ponad 30 miligramów dziennie, może powodować reakcje alergiczne i zaburzenie równowagi układu odpornościowego.