Zarówno popkorn popped, jak i poppedon mogą zostać zamrożone, ale może to wpłynąć na jakość. Niezapakowany popcorn, który został zamrożony, również nie wyskakuje, a zamarznięty popcorn, który został otwarty, staje się suchy i nieświeży. Popcorn w zapieczętowanej szczelnie torbie powinien zamarznąć.
Niepopielone jądra popcornu mają trochę wilgoci wewnątrz. Po podgrzaniu wilgoć zamienia się w parę i powoduje nagromadzenie ciśnienia w jądrze, powodując jego pęknięcie. Jeśli zamrożone, wnętrze jądra wyschnie, co może zapobiec pękaniu. Najlepiej przechowywać niezałożone jądra w chłodnej, suchej szafce, aby uzyskać najlepsze rezultaty.