Orzeszki pekan mogą trwać od dwóch miesięcy do dwóch lat. czas ich trwania zależy od metody przechowywania i temperatury. Łuskanie pekan daje im krótszy okres trwałości.
Przechowuj pekan w czystych, szczelnie zamkniętych suchych workach lub słoikach; orzechy z łatwością wchłaniają silne zapachy. Małe kawałki psują się szybciej, więc kup połówki pekan lub całe, nieskrócone orzechy. Pakiety pekan często mają datę przydatności do spożycia.
Orzeszki pekan w skorupce wystarczają na maksymalnie dwa lata, gdy są zamrożone w hermetycznych pojemnikach. Zamarznięte orzechy pekanowane po zamrożeniu należy zużyć w ciągu 18 miesięcy. Chłodzenie chroni pekan przez około dwa miesiące. Przechowywanie orzechów w temperaturze pokojowej jest najmniej skuteczną metodą i nie jest zalecane.
