Świeżo wykonane karmelowe jabłka zachowają świeżość nawet do tygodnia, gdy są przechowywane w lodówce. Jabłka karmelowe w opakowaniach jednostkowych zwykle mają okres przydatności do spożycia wynoszący około 2 tygodnie, ale będą również dłużej przechowywane w lodówce.
Jabłka karmelowe smakują najlepiej po spożyciu natychmiast po zakupie, chociaż mogą być przechowywane w lodówce w celu utrzymania ich świeżości, jeśli nie zostaną natychmiast zjedzone. Gotowe jabłka karmelowe będą miały datę "najlepszy do" na ich opakowaniu i powinny zostać zjedzone przed tą datą. W lodówce jabłka karmelowe powinny być przechowywane w temperaturze pokojowej około 45 minut przed jedzeniem, aby jabłka mogły lekko się ogrzać. Jabłka karmelowe nie powinny być zamrażane, powinny być również przechowywane z dala od bezpośredniego światła słonecznego i przechowywane w miejscu o niskiej wilgotności, aby zapobiec zepsuciu się jabłek.