Jajka na twardo mają okres ważności jednego tygodnia, jeśli są przechowywane w lodówce lub dwie godziny, jeśli są pozostawione w temperaturze pokojowej. Ochronna woskowa powłoka na skorupce jajka jest usuwana w procesie wrzenia , pozostawiając go podatnym na skażenie bakteryjne.
Usunięcie lub przechowywanie skorupki na twardo gotowanym jajku nie ma wpływu na jego trwałość. Jajka na twardo powinny być przechowywane w wodzie, odświeżane codziennie lub w hermetycznym pojemniku w lodówce. Zamrażanie zmienia strukturę komórkową jaj, a teksturę gumuje się po rozmrożeniu do temperatury pokojowej. Posiłki z jajami ugotowanymi na twardo należy spożyć w ciągu dwóch godzin od przygotowania lub schłodzić za pomocą chłodziarki lub zamrożonych opakowań żelowych.
