Około 100 gatunków roślin i ziół zawiera kofeinę. Kofeina jest rzadziej spotykana w owocach, ale orzech kola zawiera kofeinę, podobnie jak nasiona z owoców rośliny Guarana i drzewa kakaowego .
Rośliny guarany wytwarzają małe owoce, które mają nasiona o wyższej koncentracji kofeiny niż ziarna kawy. Niektóre gatunki roślin kawy coffea wytwarzają jadalne czerwone i purpurowe owoce zwane wiśniami. Te wiśnie zawierają nasiona, które zawierają kofeinę. Rośliny cytrynowe, grejpfrutowe i pomarańczowe zawierają kofeinę w liściach i kwiatach, ale nie w samych owocach.
Większość owoców pochodzących z roślin kwitnących nie zawiera kofeiny. Naturalnie występująca kofeina występująca w roślinach i nasionach często działa jako mechanizm obronny, który zniechęca roślinożerców do jedzenia rośliny.
