Wiele zwierząt je pomidory, w tym wiewiórki, króliki, jelenie i szopy pracze. Niektóre zwierzęta, takie jak świstaki, niszczą rośliny pomidora w trakcie zbierania owoców.
Trzymanie zwierząt z roślin pomidora może być trudne, a metody różnią się w zależności od zwierzęcia. Utrzymywanie jeleni za pomocą ogrodzenia może być trudne, ponieważ mogą skakać przez ogrodzenie krótsze niż około 9 stóp. Szczekanie psa jest często najlepszym środkiem odstraszającym jelenia, a koty mogą być skutecznymi ochraniaczami przed wiewiórkami i innymi małymi zwierzętami.
Dla niektórych drapieżnych zwierząt, takich jak drwal, ogrodzenie musi być zakopane na głębokości kilku stóp, aby uniemożliwić im kopanie pod nim. W przypadku bardzo inteligentnych i przystosowawczych szopów tylko pełna klatka może utrzymywać je poza roślinami pomidora. Fałszywe sowy lub węże mogą pomóc w powstrzymaniu królików.
Rozprzestrzenianie się substancji naturalnych, takich jak mocz drapieżników lub papryczka, może być nietoksycznym, skutecznym sposobem na powstrzymanie zwierząt od roślin pomidora. Niektórzy ogrodnicy sadzą więcej pomidorów, niż potrzebują, wiedząc, że niektóre zwierzęta będą się zmywać. Na niektórych obszarach właściciele domów mogą nielegalnie chwytać dzikie zwierzęta. Nawet jeśli zwierzę nie zostanie skrzywdzone, przeniesienie go poza zwykły obszar może spowodować obrażenia lub śmierć zwierzęcia.
