Picie spleśniałego soku jabłkowego może powodować lekkie zaburzenia żołądkowe lub dyskomfort w jelitach. Sok z pleśnią lub zmienionym kolorem powinien zostać odrzucony.
Sok jabłkowy w butelkach ma trwałość od 2 do 3 miesięcy po wydrukowaniu najlepiej według daty. Nieotwarty sok jabłkowy w puszkach można bezpiecznie spożyć od 6 do 9 miesięcy po wydrukowaniu.
Świeżo wyciśnięty sok jabłkowy nie powinien być przechowywany w lodówce dłużej niż 7 do 10 dni. Sok o wyższej zawartości cukru ma zazwyczaj dłuższy okres przydatności do spożycia.
Picie niepasteryzowanego soku jabłkowego wiąże się z ryzykiem zatrucia pokarmowego. Pasteryzacja służy do zabijania szkodliwych bakterii w sokach i mleku, a zatem niepasteryzowany sok jabłkowy może pójść źle wcześniej niż jego odpowiednik.
