Do częstych przyczyn skażenia żywności należą bakterie, wirusy i pasożyty wchodzące w proces produkcji podczas fazy wzrostu, zbioru, przetwarzania, wysyłki lub przygotowania. Żywność szczególnie podatna na szkodliwe zanieczyszczenia to surowe i gotowe produkty - spożywać pokarmy, takie jak produkty, które nie są gotowane przed spożyciem.
E. coli jest jednym z najczęstszych zanieczyszczeń i jest wynikiem niedogotowanej wołowiny, która została zanieczyszczona odchodami podczas uboju. Zakażenie krzyżowe żywności salmonellą jest powszechne w kuchniach, w których kucharze zajmują się surowym mięsem i drobiem za pomocą narzędzi lub nie umytych rąk, które również przetwarzają gotowane lub gotowe do spożycia produkty, co prowadzi do zatrucia pokarmem dla konsumenta.